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検索結果

検索 (著者・登録者: agirrezabala & x)の結果全49件を表示しています

EMDB-12636:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 1
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E

EMDB-12928:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 2
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E

EMDB-12929:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 3
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E

EMDB-12930:
CspA-70 cotranslational folding intermediate 2
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E

EMDB-13055:
CspA-70 cotranslational folding intermediate 1
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E

PDB-7nww:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 1
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Macher M, Liutkute M, Gil-Carton D, Novacek J, Valle M, Rodnina MV

PDB-7oif:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 2
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Macher M, Liutkute M, Gil-Carton D, Novacek J, Valle M, Rodnina MV

PDB-7oig:
CspA-27 cotranslational folding intermediate 3
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Macher M, Liutkute M, Gil-Carton D, Novacek J, Valle M, Rodnina MV

PDB-7oii:
CspA-70 cotranslational folding intermediate 2
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Macher M, Liutkute M, Gil-Carton D, Novacek J, Valle M, Rodnina MV

PDB-7ot5:
CspA-70 cotranslational folding intermediate 1
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Macher M, Liutkute M, Gil-Carton D, Novacek J, Valle M, Rodnina MV

EMDB-3785:
Structure of Watermelon mosaic virus potyvirus.
手法: らせん対称 / : Zamora M, Mendez-Lopez E

PDB-5odv:
Structure of Watermelon mosaic virus potyvirus.
手法: らせん対称 / : Zamora M, Mendez-Lopez E, Agirrezabala X, Cuesta R, Lavin JL, Sanchez-Pina MA, Aranda M, Valle M

EMDB-3618:
Bypassing 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Klimova M, Zamora M, Gil-Carton D, Rodnina M, Valle M

PDB-5np6:
70S structure prior to bypassing
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Samatova E, Klimova M, Zamora M, Gil-Carton D, Rodnina M, Valle M

PDB-5fn1:
Electron cryo-microscopy of filamentous flexible virus PepMV (Pepino Mosaic Virus)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Mendez-Lopez E, Lasso G, Sanchez-Pina MA, Aranda MA, Valle M

EMDB-3236:
Electron cryo-microscopy of filamentous flexible virus PepMV (Pepino Mosaic Virus)
手法: らせん対称 / : Agirrezabala X, Mendez-Lopez E, Lasso G, Sanchez-Pina MA, Aranda MA, Valle M

PDB-4v6n:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (50S ribosome of class2 of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6o:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (class 4a of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6p:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (class 4b of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6q:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (class 5 of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6r:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (class 6 of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6s:
Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates (class 3 of the six classes)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao H, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6k:
Structural insights into cognate vs. near-cognate discrimination during decoding.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Schreiner E, Trabuco LG, Lei J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-4v6l:
Structural insights into cognate vs. near-cognate discrimination during decoding.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Schreiner E, Trabuco LG, Lei J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-2373:
ribosome-RelA complex
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Fernandez I, Kelley A, Gil-Carton D, Ramakrishnan V, Valle M

EMDB-5359:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 4A (partially rotated (I) 70S ribosome with A-site and P-site tRNAs)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-5360:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 3 (unrotated 70S ribosome with P-site tRNA)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-5361:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 2 (unrotated 70S ribosome with A-site and P-site tRNAs)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-5362:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 6 (rotated 70S ribosome with A-site and P-site tRNAs)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-5363:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 5 (rotated 70S ribosome with A-site and P-site tRNAs)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-5364:
New mRNA-tRNA translocation intermediates revealed by cryoEM: Class 4B (partially rotated (II) 70S ribosome with A-site and P-site tRNAs)
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Liao HY, Schreiner E, Fu J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-1771:
30S Initiation Complex. 30S-IF1-IF2-IF3-tRNA-mRNA-GTP (after classification)
手法: 単粒子 / : Julian P, Milon P, Agirrezabala X, Lasso G, Gil D, Rodnina MV, Valle M

EMDB-1770:
30S-002mRNA (after classification)
手法: 単粒子 / : Julian P, Milon P, Agirrezabala X, Lasso G, Gil D, Rodnina MV, Valle M

EMDB-1849:
Cognate 70S-TC complex
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Schreiner E, Trabuco LG, Lei J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

EMDB-1850:
Near-cognate 70S-TC complex
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Schreiner E, Trabuco LG, Lei J, Ortiz-Meoz RF, Schulten K, Green R, Frank J

PDB-3izg:
Bacteriophage T7 prohead shell EM-derived atomic model
手法: 単粒子 / : Ionel A, Velazquez-Muriel JA, Agirrezabala X, Luque D, Cuervo A, Caston JR, Valpuesta JM, Martin-Benito J, Carrascosa JL

EMDB-1564:
Recognition of Phe-tRNAPhe, Trp-tRNATrp and : a common molecular mechanism for aminoacyl-tRNA selection revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Li W, Agirrezabala X, Lei J, Bouakaz L, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1565:
Recognition of Phe-tRNAPhe, Trp-tRNATrp and : a common molecular mechanism for aminoacyl-tRNA selection revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Li W, Agirrezabala X, Lei J, Bouakaz L, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1541:
Visualization of the hybrid state of tRNA binding promoted by spontaneous ratcheting of the ribosome
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Lei J, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Frank J

EMDB-1540:
Visualization of the hybrid state of tRNA binding promoted by spontaneous ratcheting of the ribosome
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Lei J, Brunelle JL, Ortiz-Meoz RF, Green R, Frank J

PDB-3ep2:
Model of Phe-tRNA(Phe) in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

PDB-3eq3:
Model of tRNA(Trp)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

PDB-3eq4:
Model of tRNA(Leu)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM
手法: 単粒子 / : Frank J, Li W, Agirrezabala X

EMDB-1321:
Quasi-atomic model of bacteriophage t7 procapsid shell: insights into the structure and evolution of a basic fold.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Velazquez-Muriel J, Gomez-Puertas P, Scheres S, Carazo JM, Carrascosa JL

EMDB-1231:
Structure of the connector of bacteriophage T7 at 8A resolution: structural homologies of a basic component of a DNA translocating machinery.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Martin-Benito J, Valle M, Gonzalez JM, Valencia A, Valpuesta JM, Carrascosa JL

EMDB-1161:
Maturation of phage T7 involves structural modification of both shell and inner core components.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Martin-Benito J, Caston JR, Miranda R, Valpuesta JM, Carrascosa JL

EMDB-1162:
Maturation of phage T7 involves structural modification of both shell and inner core components.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Martin-Benito J, Caston JR, Miranda R, Valpuesta JM, Carrascosa JL

EMDB-1163:
Maturation of phage T7 involves structural modification of both shell and inner core components.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Martin-Benito J, Caston JR, Miranda R, Valpuesta JM, Carrascosa JL

EMDB-1164:
Maturation of phage T7 involves structural modification of both shell and inner core components.
手法: 単粒子 / : Agirrezabala X, Martin-Benito J, Caston JR, Miranda R, Valpuesta JM, Carrascosa JL

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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